Protein–RNA interactions for Protein: P01795

Ig heavy chain V region M167, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01795 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01795 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01795 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01795 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01795 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01795 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01795 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01795 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01795 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01795 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01795 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01795 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01795 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01795 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01795 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01795 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01795 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01795 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01795 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01795 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01795 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01795 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01795 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01795 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01795 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01795 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01795 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01795 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01795 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01795 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01795 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01795 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01795 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01795 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01795 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01795 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01795 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01795 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01795 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01795 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01795 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01795 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01795 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01795 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01795 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01795 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01795 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01795 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01795 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01795 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01795 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01795 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01795 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01795 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01795 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01795 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01795 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01795 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01795 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01795 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01795 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01795 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01795 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01795 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01795 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01795 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01795 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01795 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01795 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01795 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01795 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01795 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01795 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01795 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01795 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01795 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01795 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01795 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01795 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01795 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01795 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01795 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01795 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01795 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01795 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01795 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01795 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01795 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01795 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01795 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01795 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01795 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01795 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01795 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01795 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01795 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01795 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01795 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01795 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01795 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms