Protein–RNA interactions for Protein: P01740

T-cell receptor gamma chain V region V108A, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01740 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01740 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01740 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01740 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01740 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01740 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01740 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01740 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01740 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01740 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01740 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01740 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01740 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01740 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01740 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01740 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01740 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01740 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01740 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01740 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01740 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01740 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01740 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01740 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01740 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01740 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01740 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01740 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01740 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01740 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01740 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01740 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
P01740 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01740 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
P01740 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01740 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01740 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01740 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01740 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01740 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01740 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01740 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01740 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01740 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
P01740 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
P01740 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
P01740 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
P01740 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01740 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01740 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01740 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01740 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01740 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01740 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01740 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01740 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
P01740 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01740 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01740 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01740 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01740 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01740 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01740 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01740 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01740 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01740 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01740 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01740 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01740 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01740 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01740 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01740 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01740 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01740 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
P01740 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01740 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01740 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01740 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
P01740 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01740 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01740 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01740 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
P01740 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01740 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01740 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01740 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01740 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01740 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01740 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01740 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01740 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01740 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01740 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
P01740 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01740 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01740 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01740 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01740 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01740 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01740 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms