Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01679 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01679 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P01679 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P01679 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01679 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01679 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01679 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01679 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P01679 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01679 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01679 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01679 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01679 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01679 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01679 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01679 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01679 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01679 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01679 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01679 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01679 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01679 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01679 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01679 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01679 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01679 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01679 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01679 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01679 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01679 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01679 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01679 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
P01679 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01679 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01679 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01679 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01679 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01679 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01679 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01679 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01679 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01679 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01679 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01679 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01679 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01679 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01679 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01679 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01679 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01679 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
P01679 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01679 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01679 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
P01679 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01679 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
P01679 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01679 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01679 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01679 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
P01679 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01679 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01679 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01679 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01679 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01679 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01679 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01679 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01679 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01679 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01679 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01679 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01679 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01679 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01679 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01679 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01679 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01679 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01679 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
P01679 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01679 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01679 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01679 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01679 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01679 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01679 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01679 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01679 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01679 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01679 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01679 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01679 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01679 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01679 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01679 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01679 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01679 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01679 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01679 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01679 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms