Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccl20O89093 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms