Protein–RNA interactions for Protein: O89026

Robo1, Roundabout homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo1O89026 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Robo1O89026 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Robo1O89026 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Robo1O89026 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Robo1O89026 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Robo1O89026 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Robo1O89026 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Robo1O89026 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Robo1O89026 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Robo1O89026 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms