Protein–RNA interactions for Protein: O89020

Afm, Afamin, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AfmO89020 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AfmO89020 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AfmO89020 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
AfmO89020 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AfmO89020 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AfmO89020 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
AfmO89020 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AfmO89020 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AfmO89020 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AfmO89020 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AfmO89020 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AfmO89020 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AfmO89020 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AfmO89020 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AfmO89020 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AfmO89020 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AfmO89020 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AfmO89020 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AfmO89020 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AfmO89020 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
AfmO89020 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AfmO89020 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AfmO89020 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AfmO89020 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AfmO89020 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AfmO89020 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AfmO89020 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AfmO89020 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AfmO89020 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AfmO89020 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AfmO89020 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AfmO89020 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AfmO89020 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AfmO89020 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AfmO89020 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AfmO89020 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AfmO89020 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AfmO89020 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AfmO89020 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AfmO89020 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
AfmO89020 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AfmO89020 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AfmO89020 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AfmO89020 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AfmO89020 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AfmO89020 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AfmO89020 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AfmO89020 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
AfmO89020 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AfmO89020 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AfmO89020 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AfmO89020 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
AfmO89020 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AfmO89020 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AfmO89020 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AfmO89020 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AfmO89020 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AfmO89020 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AfmO89020 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AfmO89020 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AfmO89020 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AfmO89020 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AfmO89020 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AfmO89020 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AfmO89020 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AfmO89020 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AfmO89020 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AfmO89020 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AfmO89020 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AfmO89020 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AfmO89020 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
AfmO89020 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AfmO89020 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
AfmO89020 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AfmO89020 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AfmO89020 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
AfmO89020 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AfmO89020 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AfmO89020 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AfmO89020 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AfmO89020 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AfmO89020 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AfmO89020 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AfmO89020 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AfmO89020 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AfmO89020 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AfmO89020 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AfmO89020 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AfmO89020 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AfmO89020 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AfmO89020 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
AfmO89020 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AfmO89020 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
AfmO89020 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
AfmO89020 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AfmO89020 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AfmO89020 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AfmO89020 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AfmO89020 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AfmO89020 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms