Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Apaf1O88879 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apaf1O88879 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apaf1O88879 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apaf1O88879 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apaf1O88879 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apaf1O88879 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apaf1O88879 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apaf1O88879 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apaf1O88879 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apaf1O88879 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apaf1O88879 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apaf1O88879 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apaf1O88879 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apaf1O88879 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apaf1O88879 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apaf1O88879 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Apaf1O88879 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apaf1O88879 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apaf1O88879 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apaf1O88879 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Apaf1O88879 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apaf1O88879 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apaf1O88879 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apaf1O88879 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apaf1O88879 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apaf1O88879 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apaf1O88879 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apaf1O88879 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apaf1O88879 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apaf1O88879 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apaf1O88879 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apaf1O88879 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apaf1O88879 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apaf1O88879 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apaf1O88879 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apaf1O88879 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Apaf1O88879 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Apaf1O88879 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apaf1O88879 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apaf1O88879 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms