Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hcn2O88703 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms