Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
BlmO88700 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BlmO88700 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
BlmO88700 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BlmO88700 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BlmO88700 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BlmO88700 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BlmO88700 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BlmO88700 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BlmO88700 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BlmO88700 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BlmO88700 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BlmO88700 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BlmO88700 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BlmO88700 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BlmO88700 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BlmO88700 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BlmO88700 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
BlmO88700 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BlmO88700 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BlmO88700 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BlmO88700 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BlmO88700 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BlmO88700 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BlmO88700 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BlmO88700 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BlmO88700 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BlmO88700 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
BlmO88700 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BlmO88700 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BlmO88700 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BlmO88700 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BlmO88700 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BlmO88700 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
BlmO88700 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BlmO88700 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BlmO88700 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BlmO88700 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BlmO88700 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BlmO88700 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
BlmO88700 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BlmO88700 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
BlmO88700 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BlmO88700 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BlmO88700 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BlmO88700 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BlmO88700 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BlmO88700 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BlmO88700 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BlmO88700 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BlmO88700 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BlmO88700 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BlmO88700 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
BlmO88700 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BlmO88700 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
BlmO88700 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BlmO88700 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BlmO88700 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BlmO88700 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BlmO88700 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
BlmO88700 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BlmO88700 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BlmO88700 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BlmO88700 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BlmO88700 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BlmO88700 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BlmO88700 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BlmO88700 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BlmO88700 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BlmO88700 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BlmO88700 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BlmO88700 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BlmO88700 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BlmO88700 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
BlmO88700 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BlmO88700 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BlmO88700 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BlmO88700 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BlmO88700 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BlmO88700 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BlmO88700 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BlmO88700 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BlmO88700 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BlmO88700 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BlmO88700 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BlmO88700 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BlmO88700 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BlmO88700 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BlmO88700 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BlmO88700 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BlmO88700 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BlmO88700 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BlmO88700 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BlmO88700 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BlmO88700 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BlmO88700 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BlmO88700 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BlmO88700 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BlmO88700 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BlmO88700 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms