Protein–RNA interactions for Protein: O88602

Cacng2, Voltage-dependent calcium channel gamma-2 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng2O88602 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacng2O88602 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms