Protein–RNA interactions for Protein: O88576

Slc6a18, Sodium-dependent neutral amino acid transporter B(0)AT3, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a18O88576 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a18O88576 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a18O88576 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a18O88576 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a18O88576 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a18O88576 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms