Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dll3O88516 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dll3O88516 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dll3O88516 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dll3O88516 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dll3O88516 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dll3O88516 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dll3O88516 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dll3O88516 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dll3O88516 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dll3O88516 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dll3O88516 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dll3O88516 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dll3O88516 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dll3O88516 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dll3O88516 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dll3O88516 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Dll3O88516 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dll3O88516 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dll3O88516 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dll3O88516 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dll3O88516 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dll3O88516 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dll3O88516 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dll3O88516 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dll3O88516 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dll3O88516 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dll3O88516 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dll3O88516 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dll3O88516 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dll3O88516 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dll3O88516 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dll3O88516 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dll3O88516 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dll3O88516 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dll3O88516 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dll3O88516 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dll3O88516 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dll3O88516 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Dll3O88516 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dll3O88516 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dll3O88516 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms