Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AvilO88398 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AvilO88398 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AvilO88398 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AvilO88398 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AvilO88398 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AvilO88398 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AvilO88398 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AvilO88398 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AvilO88398 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AvilO88398 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AvilO88398 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AvilO88398 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
AvilO88398 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AvilO88398 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AvilO88398 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AvilO88398 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AvilO88398 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AvilO88398 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AvilO88398 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AvilO88398 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AvilO88398 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AvilO88398 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
AvilO88398 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AvilO88398 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
AvilO88398 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
AvilO88398 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AvilO88398 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AvilO88398 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AvilO88398 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AvilO88398 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AvilO88398 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AvilO88398 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AvilO88398 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AvilO88398 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AvilO88398 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AvilO88398 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AvilO88398 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AvilO88398 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AvilO88398 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AvilO88398 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AvilO88398 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AvilO88398 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AvilO88398 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AvilO88398 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AvilO88398 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AvilO88398 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AvilO88398 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AvilO88398 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AvilO88398 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AvilO88398 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AvilO88398 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AvilO88398 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AvilO88398 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AvilO88398 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AvilO88398 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AvilO88398 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AvilO88398 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AvilO88398 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AvilO88398 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AvilO88398 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AvilO88398 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AvilO88398 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AvilO88398 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AvilO88398 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AvilO88398 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AvilO88398 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AvilO88398 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AvilO88398 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AvilO88398 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AvilO88398 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AvilO88398 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AvilO88398 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AvilO88398 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AvilO88398 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AvilO88398 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AvilO88398 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AvilO88398 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AvilO88398 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AvilO88398 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AvilO88398 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AvilO88398 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AvilO88398 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AvilO88398 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AvilO88398 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AvilO88398 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AvilO88398 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AvilO88398 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AvilO88398 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AvilO88398 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AvilO88398 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AvilO88398 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AvilO88398 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AvilO88398 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AvilO88398 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AvilO88398 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AvilO88398 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AvilO88398 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AvilO88398 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AvilO88398 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms