Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nid2O88322 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nid2O88322 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nid2O88322 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nid2O88322 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nid2O88322 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Nid2O88322 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nid2O88322 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms