Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vamp4O70480 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vamp4O70480 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vamp4O70480 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Vamp4O70480 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vamp4O70480 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vamp4O70480 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vamp4O70480 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vamp4O70480 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vamp4O70480 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Vamp4O70480 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vamp4O70480 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vamp4O70480 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vamp4O70480 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vamp4O70480 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vamp4O70480 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vamp4O70480 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vamp4O70480 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Vamp4O70480 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vamp4O70480 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vamp4O70480 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vamp4O70480 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vamp4O70480 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Vamp4O70480 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vamp4O70480 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vamp4O70480 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Vamp4O70480 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vamp4O70480 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Vamp4O70480 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Vamp4O70480 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Vamp4O70480 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Vamp4O70480 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vamp4O70480 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Vamp4O70480 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vamp4O70480 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vamp4O70480 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vamp4O70480 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vamp4O70480 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Vamp4O70480 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vamp4O70480 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vamp4O70480 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Vamp4O70480 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vamp4O70480 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Vamp4O70480 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vamp4O70480 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vamp4O70480 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vamp4O70480 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Vamp4O70480 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vamp4O70480 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Vamp4O70480 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Vamp4O70480 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vamp4O70480 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vamp4O70480 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vamp4O70480 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vamp4O70480 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vamp4O70480 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Vamp4O70480 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vamp4O70480 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vamp4O70480 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Vamp4O70480 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Vamp4O70480 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vamp4O70480 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vamp4O70480 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vamp4O70480 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vamp4O70480 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vamp4O70480 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vamp4O70480 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Vamp4O70480 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Vamp4O70480 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vamp4O70480 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vamp4O70480 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vamp4O70480 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vamp4O70480 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vamp4O70480 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vamp4O70480 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vamp4O70480 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vamp4O70480 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Vamp4O70480 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Vamp4O70480 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vamp4O70480 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Vamp4O70480 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vamp4O70480 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vamp4O70480 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vamp4O70480 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vamp4O70480 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Vamp4O70480 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vamp4O70480 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vamp4O70480 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vamp4O70480 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vamp4O70480 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vamp4O70480 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vamp4O70480 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vamp4O70480 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vamp4O70480 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vamp4O70480 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vamp4O70480 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Vamp4O70480 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vamp4O70480 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Vamp4O70480 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms