Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Xirp1O70373 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms