Protein–RNA interactions for Protein: O55237

Cd70, CD70 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd70O55237 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd70O55237 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cd70O55237 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd70O55237 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd70O55237 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd70O55237 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd70O55237 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd70O55237 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd70O55237 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms