Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChkbO55229 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChkbO55229 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChkbO55229 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChkbO55229 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ChkbO55229 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChkbO55229 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChkbO55229 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChkbO55229 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ChkbO55229 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ChkbO55229 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChkbO55229 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms