Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PrxO55103 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PrxO55103 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PrxO55103 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PrxO55103 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PrxO55103 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrxO55103 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PrxO55103 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrxO55103 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrxO55103 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PrxO55103 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrxO55103 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrxO55103 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PrxO55103 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrxO55103 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrxO55103 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrxO55103 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrxO55103 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrxO55103 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrxO55103 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrxO55103 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrxO55103 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrxO55103 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrxO55103 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrxO55103 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrxO55103 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrxO55103 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrxO55103 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrxO55103 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrxO55103 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrxO55103 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrxO55103 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrxO55103 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrxO55103 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrxO55103 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrxO55103 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrxO55103 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrxO55103 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrxO55103 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrxO55103 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrxO55103 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrxO55103 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrxO55103 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrxO55103 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrxO55103 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrxO55103 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrxO55103 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrxO55103 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrxO55103 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrxO55103 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrxO55103 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrxO55103 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrxO55103 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrxO55103 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrxO55103 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrxO55103 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrxO55103 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrxO55103 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrxO55103 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrxO55103 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrxO55103 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PrxO55103 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PrxO55103 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PrxO55103 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PrxO55103 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PrxO55103 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PrxO55103 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PrxO55103 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PrxO55103 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrxO55103 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrxO55103 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrxO55103 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrxO55103 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrxO55103 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrxO55103 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PrxO55103 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrxO55103 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrxO55103 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrxO55103 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrxO55103 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrxO55103 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrxO55103 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrxO55103 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrxO55103 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrxO55103 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrxO55103 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrxO55103 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrxO55103 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrxO55103 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrxO55103 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrxO55103 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrxO55103 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrxO55103 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrxO55103 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrxO55103 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrxO55103 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrxO55103 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrxO55103 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrxO55103 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrxO55103 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms