Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syngr1O55100 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms