Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trappc3O55013 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc3O55013 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms