Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NlkO54949 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NlkO54949 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NlkO54949 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NlkO54949 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NlkO54949 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NlkO54949 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NlkO54949 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NlkO54949 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NlkO54949 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NlkO54949 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NlkO54949 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NlkO54949 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NlkO54949 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NlkO54949 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NlkO54949 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NlkO54949 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NlkO54949 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NlkO54949 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NlkO54949 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NlkO54949 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NlkO54949 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NlkO54949 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NlkO54949 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NlkO54949 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NlkO54949 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NlkO54949 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NlkO54949 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NlkO54949 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NlkO54949 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NlkO54949 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NlkO54949 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NlkO54949 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NlkO54949 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NlkO54949 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NlkO54949 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NlkO54949 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NlkO54949 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NlkO54949 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NlkO54949 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NlkO54949 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NlkO54949 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NlkO54949 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NlkO54949 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NlkO54949 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NlkO54949 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NlkO54949 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NlkO54949 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NlkO54949 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NlkO54949 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NlkO54949 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NlkO54949 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NlkO54949 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NlkO54949 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NlkO54949 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NlkO54949 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NlkO54949 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NlkO54949 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NlkO54949 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NlkO54949 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NlkO54949 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NlkO54949 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NlkO54949 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NlkO54949 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NlkO54949 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NlkO54949 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NlkO54949 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NlkO54949 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NlkO54949 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NlkO54949 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NlkO54949 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NlkO54949 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NlkO54949 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NlkO54949 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NlkO54949 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NlkO54949 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NlkO54949 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NlkO54949 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NlkO54949 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NlkO54949 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NlkO54949 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NlkO54949 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NlkO54949 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NlkO54949 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NlkO54949 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NlkO54949 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NlkO54949 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NlkO54949 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NlkO54949 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NlkO54949 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NlkO54949 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NlkO54949 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NlkO54949 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NlkO54949 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NlkO54949 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NlkO54949 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NlkO54949 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NlkO54949 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NlkO54949 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NlkO54949 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms