Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EdaO54693 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EdaO54693 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EdaO54693 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EdaO54693 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EdaO54693 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EdaO54693 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EdaO54693 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EdaO54693 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EdaO54693 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EdaO54693 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EdaO54693 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EdaO54693 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EdaO54693 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EdaO54693 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EdaO54693 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EdaO54693 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EdaO54693 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EdaO54693 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EdaO54693 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EdaO54693 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EdaO54693 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EdaO54693 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EdaO54693 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EdaO54693 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EdaO54693 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EdaO54693 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EdaO54693 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EdaO54693 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EdaO54693 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EdaO54693 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EdaO54693 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EdaO54693 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EdaO54693 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EdaO54693 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EdaO54693 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EdaO54693 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EdaO54693 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EdaO54693 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EdaO54693 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EdaO54693 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EdaO54693 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EdaO54693 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EdaO54693 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EdaO54693 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EdaO54693 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EdaO54693 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EdaO54693 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EdaO54693 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EdaO54693 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EdaO54693 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EdaO54693 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EdaO54693 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EdaO54693 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EdaO54693 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EdaO54693 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EdaO54693 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EdaO54693 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EdaO54693 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EdaO54693 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EdaO54693 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EdaO54693 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EdaO54693 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EdaO54693 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EdaO54693 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EdaO54693 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EdaO54693 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EdaO54693 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EdaO54693 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EdaO54693 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EdaO54693 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EdaO54693 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EdaO54693 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EdaO54693 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EdaO54693 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EdaO54693 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EdaO54693 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EdaO54693 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EdaO54693 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EdaO54693 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EdaO54693 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EdaO54693 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EdaO54693 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EdaO54693 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EdaO54693 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EdaO54693 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EdaO54693 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EdaO54693 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EdaO54693 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EdaO54693 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EdaO54693 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EdaO54693 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EdaO54693 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EdaO54693 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EdaO54693 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EdaO54693 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EdaO54693 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EdaO54693 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EdaO54693 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EdaO54693 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms