Protein–RNA interactions for Protein: O35926

Cdk5r2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r2O35926 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk5r2O35926 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdk5r2O35926 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdk5r2O35926 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdk5r2O35926 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdk5r2O35926 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdk5r2O35926 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdk5r2O35926 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdk5r2O35926 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdk5r2O35926 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdk5r2O35926 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdk5r2O35926 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5r2O35926 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5r2O35926 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5r2O35926 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5r2O35926 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5r2O35926 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5r2O35926 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5r2O35926 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5r2O35926 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5r2O35926 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5r2O35926 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5r2O35926 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5r2O35926 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5r2O35926 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5r2O35926 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5r2O35926 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5r2O35926 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5r2O35926 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms