Protein–RNA interactions for Protein: O35912

Emp3, Epithelial membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emp3O35912 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Emp3O35912 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Emp3O35912 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Emp3O35912 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Emp3O35912 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emp3O35912 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emp3O35912 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms