Protein–RNA interactions for Protein: O35716

Socs1, Suppressor of cytokine signaling 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Socs1O35716 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Socs1O35716 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Socs1O35716 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Socs1O35716 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Socs1O35716 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Socs1O35716 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Socs1O35716 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Socs1O35716 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Socs1O35716 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Socs1O35716 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Socs1O35716 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Socs1O35716 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Socs1O35716 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Socs1O35716 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Socs1O35716 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Socs1O35716 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Socs1O35716 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Socs1O35716 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Socs1O35716 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Socs1O35716 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Socs1O35716 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Socs1O35716 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Socs1O35716 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Socs1O35716 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Socs1O35716 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Socs1O35716 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Socs1O35716 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Socs1O35716 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Socs1O35716 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Socs1O35716 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Socs1O35716 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Socs1O35716 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Socs1O35716 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Socs1O35716 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Socs1O35716 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Socs1O35716 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Socs1O35716 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Socs1O35716 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Socs1O35716 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Socs1O35716 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Socs1O35716 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Socs1O35716 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Socs1O35716 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Socs1O35716 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Socs1O35716 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Socs1O35716 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Socs1O35716 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Socs1O35716 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Socs1O35716 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Socs1O35716 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Socs1O35716 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Socs1O35716 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Socs1O35716 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Socs1O35716 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Socs1O35716 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Socs1O35716 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Socs1O35716 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Socs1O35716 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Socs1O35716 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Socs1O35716 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Socs1O35716 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Socs1O35716 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Socs1O35716 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Socs1O35716 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Socs1O35716 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Socs1O35716 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Socs1O35716 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Socs1O35716 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Socs1O35716 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Socs1O35716 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Socs1O35716 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Socs1O35716 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Socs1O35716 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Socs1O35716 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Socs1O35716 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Socs1O35716 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Socs1O35716 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Socs1O35716 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Socs1O35716 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Socs1O35716 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Socs1O35716 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Socs1O35716 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Socs1O35716 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Socs1O35716 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Socs1O35716 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Socs1O35716 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Socs1O35716 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Socs1O35716 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Socs1O35716 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Socs1O35716 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Socs1O35716 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Socs1O35716 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Socs1O35716 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Socs1O35716 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Socs1O35716 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Socs1O35716 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Socs1O35716 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Socs1O35716 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Socs1O35716 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Socs1O35716 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms