Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc27a2O35488 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc27a2O35488 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc27a2O35488 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc27a2O35488 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc27a2O35488 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc27a2O35488 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc27a2O35488 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc27a2O35488 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc27a2O35488 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc27a2O35488 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc27a2O35488 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc27a2O35488 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc27a2O35488 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc27a2O35488 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc27a2O35488 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc27a2O35488 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc27a2O35488 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc27a2O35488 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc27a2O35488 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc27a2O35488 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc27a2O35488 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc27a2O35488 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc27a2O35488 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc27a2O35488 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc27a2O35488 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc27a2O35488 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc27a2O35488 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc27a2O35488 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc27a2O35488 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc27a2O35488 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc27a2O35488 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc27a2O35488 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc27a2O35488 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc27a2O35488 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc27a2O35488 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc27a2O35488 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc27a2O35488 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc27a2O35488 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc27a2O35488 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slc27a2O35488 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slc27a2O35488 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slc27a2O35488 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slc27a2O35488 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slc27a2O35488 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slc27a2O35488 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slc27a2O35488 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slc27a2O35488 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slc27a2O35488 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc27a2O35488 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms