Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TnxbO35452 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TnxbO35452 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TnxbO35452 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TnxbO35452 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TnxbO35452 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
TnxbO35452 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TnxbO35452 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
TnxbO35452 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TnxbO35452 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TnxbO35452 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TnxbO35452 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TnxbO35452 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TnxbO35452 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TnxbO35452 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TnxbO35452 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
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TnxbO35452 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms