Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Abcc1O35379 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Abcc1O35379 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Abcc1O35379 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Abcc1O35379 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Abcc1O35379 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Abcc1O35379 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Abcc1O35379 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Abcc1O35379 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Abcc1O35379 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Abcc1O35379 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Abcc1O35379 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Abcc1O35379 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Abcc1O35379 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Abcc1O35379 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Abcc1O35379 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Abcc1O35379 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Abcc1O35379 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Abcc1O35379 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Abcc1O35379 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Abcc1O35379 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Abcc1O35379 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Abcc1O35379 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Abcc1O35379 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Abcc1O35379 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Abcc1O35379 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Abcc1O35379 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Abcc1O35379 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Abcc1O35379 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Abcc1O35379 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Abcc1O35379 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Abcc1O35379 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Abcc1O35379 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Abcc1O35379 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Abcc1O35379 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Abcc1O35379 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Abcc1O35379 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Abcc1O35379 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms