Protein–RNA interactions for Protein: O35372

Cnih1, Protein cornichon homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih1O35372 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih1O35372 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih1O35372 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih1O35372 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih1O35372 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih1O35372 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih1O35372 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih1O35372 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih1O35372 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih1O35372 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih1O35372 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih1O35372 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih1O35372 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih1O35372 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih1O35372 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih1O35372 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih1O35372 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih1O35372 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih1O35372 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih1O35372 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih1O35372 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih1O35372 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih1O35372 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih1O35372 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih1O35372 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih1O35372 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnih1O35372 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih1O35372 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih1O35372 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih1O35372 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih1O35372 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih1O35372 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih1O35372 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih1O35372 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih1O35372 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih1O35372 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih1O35372 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih1O35372 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih1O35372 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih1O35372 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih1O35372 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih1O35372 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih1O35372 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih1O35372 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih1O35372 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih1O35372 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih1O35372 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih1O35372 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih1O35372 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnih1O35372 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnih1O35372 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnih1O35372 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnih1O35372 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnih1O35372 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnih1O35372 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnih1O35372 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih1O35372 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih1O35372 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih1O35372 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih1O35372 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih1O35372 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih1O35372 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih1O35372 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih1O35372 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih1O35372 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih1O35372 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih1O35372 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih1O35372 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih1O35372 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih1O35372 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih1O35372 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih1O35372 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih1O35372 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih1O35372 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih1O35372 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih1O35372 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih1O35372 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih1O35372 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih1O35372 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih1O35372 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih1O35372 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnih1O35372 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih1O35372 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih1O35372 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih1O35372 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih1O35372 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih1O35372 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih1O35372 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih1O35372 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih1O35372 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih1O35372 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih1O35372 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih1O35372 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih1O35372 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih1O35372 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih1O35372 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih1O35372 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih1O35372 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih1O35372 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnih1O35372 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms