Protein–RNA interactions for Protein: O35367

Kera, Keratocan, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KeraO35367 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KeraO35367 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KeraO35367 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KeraO35367 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KeraO35367 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KeraO35367 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KeraO35367 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KeraO35367 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KeraO35367 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KeraO35367 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KeraO35367 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KeraO35367 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KeraO35367 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KeraO35367 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KeraO35367 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KeraO35367 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KeraO35367 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KeraO35367 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KeraO35367 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KeraO35367 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KeraO35367 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KeraO35367 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KeraO35367 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KeraO35367 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KeraO35367 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KeraO35367 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KeraO35367 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KeraO35367 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KeraO35367 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KeraO35367 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KeraO35367 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KeraO35367 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KeraO35367 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KeraO35367 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KeraO35367 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KeraO35367 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KeraO35367 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KeraO35367 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KeraO35367 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KeraO35367 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KeraO35367 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KeraO35367 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KeraO35367 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KeraO35367 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KeraO35367 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KeraO35367 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KeraO35367 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KeraO35367 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KeraO35367 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KeraO35367 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KeraO35367 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KeraO35367 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KeraO35367 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KeraO35367 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KeraO35367 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KeraO35367 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KeraO35367 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KeraO35367 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KeraO35367 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KeraO35367 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KeraO35367 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KeraO35367 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KeraO35367 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KeraO35367 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KeraO35367 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KeraO35367 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
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KeraO35367 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KeraO35367 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KeraO35367 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KeraO35367 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KeraO35367 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KeraO35367 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KeraO35367 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KeraO35367 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KeraO35367 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KeraO35367 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KeraO35367 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KeraO35367 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KeraO35367 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KeraO35367 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KeraO35367 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KeraO35367 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KeraO35367 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KeraO35367 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KeraO35367 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KeraO35367 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KeraO35367 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KeraO35367 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KeraO35367 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KeraO35367 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KeraO35367 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KeraO35367 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KeraO35367 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KeraO35367 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KeraO35367 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KeraO35367 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
KeraO35367 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KeraO35367 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KeraO35367 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms