Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kpna3O35344 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms