Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kpna4O35343 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms