Protein–RNA interactions for Protein: O35261

E2f3, Transcription factor E2F3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f3O35261 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2f3O35261 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
E2f3O35261 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2f3O35261 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2f3O35261 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2f3O35261 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2f3O35261 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms