Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Polr1aO35134 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Polr1aO35134 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms