Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ArxO35085 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ArxO35085 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ArxO35085 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ArxO35085 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ArxO35085 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ArxO35085 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ArxO35085 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ArxO35085 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ArxO35085 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ArxO35085 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ArxO35085 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ArxO35085 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ArxO35085 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ArxO35085 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ArxO35085 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ArxO35085 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ArxO35085 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ArxO35085 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ArxO35085 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ArxO35085 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ArxO35085 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ArxO35085 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ArxO35085 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ArxO35085 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ArxO35085 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ArxO35085 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ArxO35085 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ArxO35085 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ArxO35085 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ArxO35085 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ArxO35085 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ArxO35085 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ArxO35085 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ArxO35085 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ArxO35085 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ArxO35085 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ArxO35085 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ArxO35085 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ArxO35085 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ArxO35085 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ArxO35085 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ArxO35085 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ArxO35085 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ArxO35085 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ArxO35085 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ArxO35085 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ArxO35085 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ArxO35085 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ArxO35085 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ArxO35085 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ArxO35085 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ArxO35085 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ArxO35085 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ArxO35085 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ArxO35085 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ArxO35085 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ArxO35085 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ArxO35085 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ArxO35085 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ArxO35085 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ArxO35085 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ArxO35085 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ArxO35085 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ArxO35085 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ArxO35085 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ArxO35085 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ArxO35085 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ArxO35085 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ArxO35085 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ArxO35085 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ArxO35085 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ArxO35085 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ArxO35085 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ArxO35085 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ArxO35085 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ArxO35085 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ArxO35085 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ArxO35085 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ArxO35085 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ArxO35085 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ArxO35085 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ArxO35085 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ArxO35085 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ArxO35085 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ArxO35085 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ArxO35085 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ArxO35085 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ArxO35085 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ArxO35085 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ArxO35085 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ArxO35085 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ArxO35085 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ArxO35085 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ArxO35085 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ArxO35085 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ArxO35085 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ArxO35085 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ArxO35085 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ArxO35085 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms