Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn4O35054 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms