Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casq1O09165 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Casq1O09165 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casq1O09165 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casq1O09165 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casq1O09165 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casq1O09165 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Casq1O09165 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Casq1O09165 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Casq1O09165 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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