Protein–RNA interactions for Protein: O09108

Lhb, Lutropin subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LhbO09108 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LhbO09108 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LhbO09108 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LhbO09108 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LhbO09108 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LhbO09108 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LhbO09108 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LhbO09108 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LhbO09108 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LhbO09108 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LhbO09108 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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LhbO09108 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LhbO09108 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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LhbO09108 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LhbO09108 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LhbO09108 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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LhbO09108 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
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LhbO09108 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LhbO09108 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LhbO09108 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LhbO09108 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LhbO09108 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
LhbO09108 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
LhbO09108 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LhbO09108 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LhbO09108 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LhbO09108 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LhbO09108 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LhbO09108 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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LhbO09108 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LhbO09108 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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LhbO09108 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LhbO09108 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LhbO09108 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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LhbO09108 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LhbO09108 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LhbO09108 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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LhbO09108 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LhbO09108 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LhbO09108 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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LhbO09108 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LhbO09108 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LhbO09108 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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LhbO09108 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LhbO09108 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LhbO09108 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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LhbO09108 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
LhbO09108 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LhbO09108 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LhbO09108 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
LhbO09108 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LhbO09108 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LhbO09108 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LhbO09108 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LhbO09108 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LhbO09108 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LhbO09108 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LhbO09108 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LhbO09108 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LhbO09108 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LhbO09108 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LhbO09108 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LhbO09108 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LhbO09108 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LhbO09108 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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