Protein–RNA interactions for Protein: O09000

Ncoa3, Nuclear receptor coactivator 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa3O09000 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ncoa3O09000 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ncoa3O09000 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ncoa3O09000 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ncoa3O09000 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ncoa3O09000 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ncoa3O09000 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ncoa3O09000 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ncoa3O09000 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ncoa3O09000 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ncoa3O09000 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ncoa3O09000 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ncoa3O09000 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ncoa3O09000 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ncoa3O09000 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ncoa3O09000 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms