Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eftud2O08810 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Eftud2O08810 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms