Protein–RNA interactions for Protein: O08740

Polr2j, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2jO08740 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr2jO08740 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Polr2jO08740 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Polr2jO08740 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2jO08740 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2jO08740 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2jO08740 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2jO08740 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2jO08740 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2jO08740 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2jO08740 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2jO08740 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2jO08740 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2jO08740 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2jO08740 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2jO08740 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms