Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sec22bO08547 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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