Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

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Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20878L7N244 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20878L7N244 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20878L7N244 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20878L7N244 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20878L7N244 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20878L7N244 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20878L7N244 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20878L7N244 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20878L7N244 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20878L7N244 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20878L7N244 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20878L7N244 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20878L7N244 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20878L7N244 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20878L7N244 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20878L7N244 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20878L7N244 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20878L7N244 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20878L7N244 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20878L7N244 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20878L7N244 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20878L7N244 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20878L7N244 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20878L7N244 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20878L7N244 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20878L7N244 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20878L7N244 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20878L7N244 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20878L7N244 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20878L7N244 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20878L7N244 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20878L7N244 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20878L7N244 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20878L7N244 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20878L7N244 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm20878L7N244 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20878L7N244 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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