Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm20939L7N243 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20939L7N243 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms