Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3542K7N6U2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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