Protein–RNA interactions for Protein: K7N6J5

Vmn1r127, Taste receptor type 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r127K7N6J5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r127K7N6J5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms