Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8888J3QPX5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm8888J3QPX5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm8888J3QPX5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm8888J3QPX5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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