Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Gm5225J3QPL3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Gm5225J3QPL3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm5225J3QPL3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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