Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS2

1700014D04Rik, MCG148436, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700014D04RikJ3QMS2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms